המחלקה לאוקיאנוגרפיה פיזיקלית כוללת שלושה חוקרים, מספר סטודנטים בוגרים וארבעה עוזרי מחקר. המחלקה מובילה מחקרים שוטפים שונים של הים התיכון, ים סוף, מפרץ אילת (עקבה), תעלת סואץ ועוד. באופן ספציפי, המחלקה מתמקדת בדינמיקת הקישוריות של אזורי מעבר בין יבשה לים, פיזיקה של מיצרים, זרמים, אינטראקציות בין החוף לים רדוד ופתוח, זרמי צפיפות, הסעת גופי מים (קונבקציה) באוקיינוס פתוח, אינטראקציות אוויר-ים, קישוריות בין אזורים מוגנים ימיים, דינמיקה של קניונים תת ימיים, ועוד. המחלקה מפעילה מספר פלטפורמות מחקר ביניהם; שלושה דאונים ימיים (גליידרים), תחנות ניטור מתאו-ימי בחופי ובעומק הים, תשתית מדידה בספינת המחקר 'בת גלים', מערכת זיהוי והתראה לגלי צונאמי. כמו כן, המחלקה הקימה ומפעילה את מרכז המידע ISRAMAR, ומפעילה מערכת לגילוי דליפת נפט (בסמוך למעקב והפצת תחזיות בזמן אמת).
| חוקרים | תחומי מחקר | מייל |
| דר' אלי ביטון – ראש המחלקה | מינים מהגרים, פליאו-אוקיאנוגרפיה, מודלים, פיזיקת מיצרי הים, אוקיאנוגרפיה פיזיקאלית | elib@ocean.org.il |
| דר' איזק גרטמן | קליטת ועיבוד נתונים, ניתוח נתונים, אוקיאנוגרפיה פיזיקאלית, חיזוי ומודלים ימיים | isaac@ocean.org.il |
| דר' איה לזר | אוקיאנוגרפיה פיזיקאלית, חקר מערבלים, סימולציה נומרית, מודלים | ayahlazar@ocean.org.il |
| עוזרי מחקר | מייל |
| דר' טל עוזר | tal@ocean.org.il |
| יותם פדידא | yotam@ocean.org.il |
| רון גולדמן | ron@ocean.org.il |
| יבגניה קריבנקו | yevgeniya@ocean.org.il |
